Suite à des protestations et à des sit-in d'étudiants et d'enseignants au niveau de l'Université des sciences Islamiques de Constantine,mi-mai 2005, le ministère a rappelé qu'il n'a jamais été question de supprimer l'enseignement des sciences islamiques des programmes officiels de l'Education nationale, et que cet enseignement est présent dans les programmes, à partir de la première année de l'enseignement primaire jusqu'à la fin de la deuxième année de l'enseignement secondaire dans toutes les filières.
Il rappelle, cependant, que huit spécialités sur les quinze qui existaient dans le cycle secondaire ont été reportées vers le cycle d'études universitaires, graduellement, dès la prochaine rentrée scolaire 2005-2006…
Il s'agit des techniques comptables, lettres et sciences humaines, lettres et sciences islamiques, électronique, électromécanique, fabrication mécanique, chimie, travaux publics et bâtiment
Les huit spécialités qui ne figurent plus dans la nomenclature des filières de l'enseignement secondaire n'ont pas été supprimées de la gamme des spécialités universitaires, et les Instituits supérieurs des sciences islamiques existants continueront à l'être et à accueillir les diplômés de l'enseignement secondaire pour leur offrir un enseignement de qualité dans les différentes spécialités des sciences islamiques.